A Nyilas Misi Alapítvány 1999-től végzi tevékenységét.

Az Alapítvány elsődleges célja a hátrányos helyzetű gyermekeken való segítés és a diákok támogatása, hogy lelki-testi otthont adjon a fiatalok és gyermekek számára. Ennek az igénynek megfelelően a házban cserkész szoba, konferenciaterem, imaterem, foglalkoztatók, irodalmi pince, konditerem, egyházi könyvesbolt, 35 fős ifjúsági szálláshely, ifjúsági lelkész-, és gondnoklakás, az udvaron játszótér, sportpálya, nyári foglalkoztató, előadások, koncertek, táncházak számára is hasznosítható nyitott-fedett szín található.

Az alábbi összegzés ízelítőt ad a Nyilas Misi Alapítvány szerteágazó, igényes munkájáról:

• A Nyilas Misi házban kapott helyet a Bató Eszter-emlékszoba, melynek látogathatóságát (bejelentkezésre) az alapítvány biztosítja.
• 2003-tól kéthetenként működik csángó-magyar táncház az Esztenás együttes zenéjével és tánctanítással, ahová az óvodás és kisiskolás korúakat is családtagjaikkal együtt várják.
• 2005-2010 között heti rendszerességgel magyar tánctanfolyam működött a házban.
• A nemzeti ünnepekre híres zenészeket hívnak meg minden évben
• Irodalmi pinceklub és irodalmi esték: Misztrál Együttes, Maczkó Mária és Szabó András estje, Wass Albert és más erdélyi írók, költők műveiből előadások Kiss Törék Ildikó és Varga Vilmos előadásában. Évekig az Irodalmi Rádió estjeinek is otthont adott a ház.
• Történelmi előadások
• Filmvetítések
• Értékteremtő programsorozatok
• Népfőiskola anyaországbelieknek és határon túli magyaroknak.
• Cserkészmozgalom: A II. Kerület irodája, valamint saját cserkészcsapatuk, a 784. sz. ERŐ csapat otthona is a Házban található meg. Téli és nyári tábort szerveznek.  2010-től ismeretterjesztő előadásokat tartanak fiataloknak
• Hitéleti tevékenység: ifjúsági bibliaóra, Vasárnapi Iskola, imaóra, a Misi mókus családos ovis klub, a MAGszimum nevű egyetemista, főiskolás, fiatal felnőtt bibliaóra.
• Prevenciós jellegű előadások: 1991-2009-ig szombat délelőttönként Iszákosmentő Misszió.
• Honismereti kirándulásokat szerveznek regionális jelleggel, és régiók között.
• Nyári táborok: Angol nyelvű bibliatáborok, honismereti, vagy kézműves nyári tábor (Helyszínek: Tiszabercel, Sárospatak, Zádorfalva, Jósvafő, Fehérkőlápa, Balatonfenyves, Bükkszék, Székesfehérvár, Drégelypalánk, Erdélyi körutak)
• Bentlakásos hétvégék: félévente szervezik, közös játék, vetélkedők, áhítat, éneklés, kézművesség, kirándulás alkotja a program alapját.
• Ifjúsági csendesnap: a gimnazista-egyetemista korosztály a célközönség. 2005-ben a téma „a Keresztyén párkapcsolat a XXI. Században” volt, melyen 100-150 fő vett részt.
• 2 éve szerveznek jótékonysági filléres karácsonyi vásárt, melynek bevételéből élelmiszercsomagokat készítenek.